白癜风如何治愈 https://m-mip.39.net/nk/mipso_4626906.html胰腺癌转录组实战2:sra转fastq格式、质控
问题代码
生成批量代码
ls~/data/sra/GSE/SRR*
whilereadiddoecho"fastq-dump--gzip--split-e-X-O${fqdir}${id}"donesra2fq.sh
纠错方式:
删掉-X这一句
因为fastq-dump这个命令,-X参数是这个意思:
-X是为了演示方便,加快速度,实际我们是要拆分所有reads的
怪不得后面我得到的counts值非常低,估计就是这个问题
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