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基于游离DNA的双重表观修饰模型,华西医 [复制链接]

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胰腺癌是全球范围内恶性程度最高的实体肿瘤之一。年,中国国家癌症中心发布数据显示,我国胰腺癌患者平均五年生存率为7.2%,位列所有癌种的末尾;而根据胰腺癌专业网站PanCAN公布的最新信息,即便在医疗条件相对成熟的美国,胰腺癌患者的整体五年生存率也仅有9%,同样在癌症生存率榜单的最底部。肿瘤进展飞快、治疗预后极差、症状无比隐匿,这些特质让胰腺癌被冠以“癌王”的称号。如何应用更高效的技术实现对胰腺癌的早期筛查,是全球相关领域内的重点工作。年7月23日,表观遗传学研究国际著名期刊ClinicalEpigenetics刊载了来自医院研究团队的突破性成果。这则名为《游离DNA表观遗传标志物联合模型用于胰腺癌诊断》(Integratedepigeneticbiomarkersincirculatingcell-freeDNAasarobustclassifierforpancreaticcancer)的成果论文,证明利用游离DNA(cell-freeDNA,cfDNA)中胞嘧啶的甲基化修饰(5-methylcytosine,5mC)联合羟甲基化修饰(5-hydroxymethylcytosine,5hmC),可建立高效的胰腺癌无创诊断方法。医院胰腺外科副主任李昂教授,四川大学生物治疗国家重点实验室研究员、泰莱生物顾问科学家谢丹教授为本项成果论文的通讯作者。研究人员利用基于游离甲基化DNA免疫沉淀的高通量测序技术(Cell-freemethylatedDNAimmunoprecipitationandhigh-throughputsequencing,cfMeDIP-seq)对例血浆样品中的cfDNA进行了甲基化研究,其中包括67例胰腺导管癌(PDAC)和97例健康对照。同时对该67例胰腺导管癌病人的血浆样品和例健康对照样品进行了基于选择性化学标记的游离羟甲基化DNA测序。在数据分析方面,研究团队采用bp固定peak长度的callpeak方法,更多
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