撰文
Qi
#胰腺癌#
胰腺导管腺癌（Pancreaticductaladenocarcinoma,PDAC）是一种高致死性和难治性癌症。因此，迫切需要破译术前治疗对残留癌细胞和基质的影响，以确定额外的治疗漏洞。一方面大多数先前研究分析的是未经治疗的患者肿瘤，另一方面尽管知道肿瘤微环境（TME）会影响细胞毒性治疗的效果，但人们对TME中的空间结构和多细胞相互作用的理解仍然有限。
近日，来自美国哈佛-MIT博德研究所的AvivRegev团队和MIT的TylerJacks团队在NatureGenetics杂志上合作发表了一篇题为Single-nucleusandspatialtranscriptomeprofilingofpancreaticcanceridentifiesmulticellulardynamicsassociatedwithneoadjuvanttreatment的文章，他们通过snRNA-seq和全转录组数字空间分析（DSP）对43个接受新辅助放化疗（CRT）或未接受的原发性PDAC肿瘤标本构建了构成PDAC的细胞亚型和空间群落的高分辨率分子景观，为临床试验中的分层提供一个框架，并作为针对特定细胞表型和多细胞相互作用的治疗靶向的潜在策略。
作者从43名PDAC患者（25位接受新辅助治疗，18位未接受）中收集了份snRNA-seq样本，确定了33个细胞亚群并根据已知的基因特征进行注释。随后利用非负矩阵分解（cNMF）从头学习跨不同肿瘤的恶性细胞和癌症相关成纤维细胞（CAF）的反复表达程序，尤其
